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PCR實驗室分區(qū)能杜絕污染嗎?分3區(qū)還是4區(qū)?

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目前PCR實驗室建設(shè)要求至少應該分為三個區(qū)域,即試劑準備區(qū)、核酸制備區(qū)和PCR擴增區(qū),如果要對擴增產(chǎn)物進行開放性鑒定,如雜交、電泳等操作,原則需要增加第四個區(qū)。實驗室分區(qū)的主要目的是避免純化核酸和擴增產(chǎn)物逆向污染前一個區(qū)域,但多年的經(jīng)驗表明,無論是三區(qū)還是四區(qū)的設(shè)置,似乎都沒有完全杜絕實驗室污染的發(fā)生。


反而羅氏COBAS“一體機”引入實驗室后,乙肝20IU/ML的敏感性能夠長期保持良好,極少有系統(tǒng)污染的發(fā)生,實驗室分區(qū)的意義受到一定程度的質(zhì)疑!仔細對比就不難發(fā)現(xiàn),羅氏COBAS并不能避免樣本交叉污染,因為這一環(huán)節(jié)是由實驗室工作人員完成的,是管理問題而不是檢驗問題;COBAS在核酸制備過程中,經(jīng)常發(fā)生核酸純化的Tip頭吹出氣泡和氣泡破裂的情況,雖然這種情況并不常見,但核酸純化和試劑分配共用一個空間是事實,有研究報道,COBAS檢測28個樣本,有2個污染(JCM, 2011,P2854-2858),我們也從21個陰性樣本中發(fā)現(xiàn)一個污染,COBAS的污染就像普通實驗室一樣存在,但令人驚奇的是,從未像普通實驗室那樣發(fā)生系統(tǒng)性污染,但有一點可以說明,氣溶膠或許并不是實驗室污染的主要原因。


分析我國大多PCR實驗室的檢測項目不難發(fā)現(xiàn),近80%的實驗室采用熒光PCR試劑盒進行臨床檢測,即這部分實驗室不存在開放性核酸鑒定環(huán)節(jié),試劑工作液的配制多在核酸制備完成后進行,依存“試劑配置與PCR擴增之間的時間越短越好”的原則,多數(shù)實驗室的試劑配制均在核酸制備室完成,也就是說,試劑配制室的存在基本被忽視,了解了羅氏COBAS的操作方式,這種做法便顯得無可厚非!核酸制備完成并加入PCR反應液后,移管到擴增室,由于采用封閉核酸鑒定的方法,這樣擴增室的設(shè)置也同樣顯得多余!以羅氏COBAS為鏡,臨床PCR實驗室是否分區(qū)便顯得無足輕重了!但這并不是說PCR實驗室不需要分區(qū),因為儀器自動化控制的機械臂,與實驗室操作人員的操作習慣和對規(guī)則的執(zhí)行力是有著本質(zhì)差別的!這或許就是經(jīng)過嚴格分區(qū)后的實驗室,污染同樣存在的主要原因!

那么PCR實驗室究竟應如何建設(shè)才能有利于污染的預防和有效清除?

其實污染就是PCR擴增管中摻入了原來樣本不存在的擴增核酸,那么這個不受歡迎的核酸是怎么來到PCR擴增管里的?如果排除試劑盒、儀器和人員操作等環(huán)節(jié),核酸氣溶膠和灑落的樣本與核酸的清除是實驗室建設(shè)應該重點考慮的環(huán)節(jié)。

實驗室的建設(shè)首先要有通風設(shè)置,通風是PCR實驗室建設(shè)應該考慮的基本條件,如果采用封閉彩鋼板建設(shè)的實驗室,應進行壓差設(shè)置,即自試劑準備室、核酸制備室到擴增室依次呈負壓,但清潔新風應從室外引進,新風過濾網(wǎng)應定期更換,否則便成為污染的來源。其次是實驗室墻面和地面具有防水功能,也就是墻面和地面可以水洗!每個房間設(shè)置地漏,方便“實驗室的清潔”,當實驗室污染發(fā)生時,即可使用“水洗實驗室”的方法有效清除污染,清除過程使用的是0.2%有效氯溶液,它不但有效斷裂核酸片段,而且還具有淬滅熒光基團,有利于PCR實驗室熒光本底的去除。但過量使用反而會影響試劑擴增效率。消毒液清洗后應該使用自來水或清潔水進行再次清洗,特別是設(shè)備表面。實驗室空氣中的污染清除,可以用有效氯溶液進行噴霧。

總之,PCR實驗室過度分區(qū)和分割,不但浪費空間,影響人員操作,常常不利于污染物的擴散和清除,相信在不久的將來,隨著試劑盒技術(shù)的發(fā)展,一個房間可實現(xiàn)PCR的試劑準備、核酸純化和PCR擴增的所有功能,而污染的預防和清除也會顯得十分簡單。
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Tags:PCR實驗室

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